由于每个女性对于疼痛的耐受程度不同，所以做试管婴儿时女性所感受的痛苦程度也是因人而异的。
首先女性在促排卵治疗后，取卵会有一定的痛苦，如果是打促排卵针，在促进卵泡发育过程中有些药物会产生过度刺激，有时甚至可能出现胸腹水等体液方面的严重并发症，而且取卵也属于是有创操作，该过程是不打麻药的，有的女性可能会无法耐受。
其次，进行试管婴儿对于女性的心理上也会造成煎熬，因为做胚胎移植手术不一定会成功，有时甚至进行多次之后仍然移植失败，这个过程中女性心理上承受着巨大的压力，有些女性心理素质差甚至可能会有抑郁等不良情绪。
